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ProgrammeJeudi 6 Juillet 2017
12h00-13h30 - Accueil des participants, déjeuner
13h30-16h00 – Session 1: Problèmes et stratégies sur données “omiques” Cette session serait dédiée à la présentation de stratégies déployées dans des approches génomiques, transcriptomique, métabolomique et phylogénétique, incluant l’outil informatique. L’objectif est de mettre en évidence certains problèmes et de présenter une manière pour les traiter, incluant la présentation de programmes informatiques utilisés. La présentation de Galaxy permettra d’apporter une initiation sur la manière de traiter des données génomiques et transcriptomiques.
13h30 – 14h15 Christophe Antoniewski, ARTbio, Institut de Biologie Paris Seine, Paris 14h15 – 14h45 Yves Bigot/Benoît Piégu, Elements génétiques mobiles, INRA, Nouzilly 14h45 – 15h15 Nicolas Daccord, IHRS, Angers 14h15 – 15h45 Pierre Nicolas, MaiAGEs, INRA, Jouy-en-Josas
15h45-16h15 Pause
16h15-18h15 Introduction à Galaxy, format interactif, EA2106 17h15-18h45 Thibault Guinoiseau, INSERM/PST ASB, Tours
19h00: Soirée de colloque et dîner sous forme de buffet (CROUS ou MDE sur le campus)
Vendredi 7 Juillet 2017
08h30-10h15 – Session 2: Analyses intégratives et réseaux Cette seconde session sera plus axée sur le post-process des données. L’objectif serait de montrer l’importance de la visualisation et du traitement ainsi que de l’intégration des données de plusieurs sources pour faire ressortir une information biologique. La présentation de Cytoscape sera l’occasion d’illustrer l’intérêt de ce traitement.
08h30 – 09h15 Olivier Poch, Complex Systems and Translational Bioinformatic, Strasbourg 09h15 – 09h45 Laurence Liaubet, GenPhySE, INRA, Toulouse
09h45-10h15 Pause
10h15-11h45 Introduction à Cytoscape, format démo Yves Vandenbrouck , CEA Grenoble
11h45-12h15 Marc Clastre, EA2106, Université François Rabelais, Tours 12h15-13h00 Véronique Brunaud, Genomic networks, IPS2, Paris-Saclay
13h00-14h30 Déjeuner |
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